Amethist heeft een beschermende en zuiverende werking. De steen bevordert zelfbewustzijn en helpt je eerlijk te zijn over gedrag dat schadelijk kan zijn en je hogere zelf niet dient. Het helpt je bijvoorbeeld verslavingen te herkennen en aan te pakken. Bovendien geeft de steen inzicht in emotionele processen, waardoor je bepaalde (pijnlijke) ervaringen kunt verwerken en vermijdingsgedrag op dit gebied kunt veranderen. Vanwege zijn reinigende eigenschappen is amethist ook zeer geschikt voor het zuiveren van een ruimte. In combinatie met bergkristal en rozenkwarts creëert het een harmonieuze sfeer. Omdat het de hogere chakra's stimuleert, kan het de intuïtie, spirituele groei en inzichten versterken, vooral voor mensen die aan het begin van hun spirituele reis staan. Amethist heeft ook een reinigende werking op het lichaam en een positieve invloed op het zenuwstelsel, hoofdpijn en migraine, nachtmerries en andere slaapproblemen.